Coral Lab: Mikrobiyal Biyoteknoloji ve Moleküler Biyoloji Laboratuvarı

Laboratuvarımızda Bakteriyel selüloz ve doku mühendisliği çalışmaları ve Bakteriyofaj izolasyonu, karakterizasyonu ve biyoteknolojik kullanım olanakları üzerine projeler yürütmekteyiz. Laboratuvarımız, ODTÜ, ME.Ü. Biyoteknolojik Araştırmalar ve uygulama merkezi ve Diş Hekimliği Fakültesi ile ortak projeler yapmaktadır.

KirdokLab: Antik DNA, Metagenomik ve Biyoinformatik Laboratuvarı

KirdokLab, antik DNA, metagenomik ve biyoinformatik alanlarında çalışan disiplinlerarası bir araştırma grubudur. Amacımız, geçmiş mikrobiyal toplulukların evrimini ve insan kültürleriyle etkileşimini moleküler düzeyde anlamaktır.

Çalışmalarımız antik oral mikrobiyom, sediman DNA ve metagenomik veriler üzerine yoğunlaşır. Anadolu’nun Neolitik yerleşimlerinden Çatalhöyük, Ortaçağ İznik kazı alanı ve İspanya’daki El Portalón (Atapuerca) mağarası gibi örneklerle, mikrobiyal toplulukların zaman içindeki değişimlerini inceliyoruz.

Biyoinformatik uzmanlığımızı kullanarak antik DNA verilerini metagenom-assembled genome (MAG) analizleri, RNA-seq ve metabolik modelleme yaklaşımlarıyla birleştiriyoruz. Böylece hem antik hem modern mikrobiyal sistemlerin biyolojik potansiyellerini karşılaştırıyoruz.

KirdokLab, Stockholm Üniversitesi, Hacettepe Üniversitesi, Orta Doğu Teknik Üniversitesi ve Gebze Teknik Üniversitesi ile ortak çalışmalar yürütmektedir.