Diş Hekimliği Fakültesi akademik yapılanması iki ana bölümden oluşmaktadır: Klinik Bilimler Bölümü ve Temel Bilimler Bölümü. Klinik Bilimler Bölümü, öğrencilerin mesleki bilgi, beceri ve tutumlarını bilimsel temeller doğrultusunda geliştirmeyi amaçlarken; Temel Bilimler Bölümü, diş hekimliği eğitiminde temel tıp ve biyomedikal bilgilerin kazandırılmasını hedeflemektedir. Her iki bölüm, çağdaş eğitim anlayışı doğrultusunda birbirini tamamlayarak fakültenin bilimsel, eğitsel ve toplumsal misyonunu desteklemektedir.